青色申告は、税務署に対して「きちんとした経理をしていきますよ」と宣言して、確定申告書を提出する事です。
「きちんとした経理をしていきますよ」と宣言するために、開業時から２か月以内に「青色申告承認申請書」を税務署に提出する必要があります。

青色申告のメリットとしては、この青色申告承認申請書を提出＋きちんとした経理で作った確定申告書を作成することで、６５万円余分に経費を付けることができます。

またきちんとした経理とは、原則として正規の簿記の原則にしたがった損益計算書（Ｐ／Ｌ、利益の計算）と貸借対照表（Ｂ／Ｓ、資産の額）を作成する事をいいます。

詳しくは国税庁ＨＰより：https://www.nta.go.jp/taxanswer/shotoku/2070.htm